Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LIN28AQ9H9Z2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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