Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C11orf49Q9H6J7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms