Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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