Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H9

SRCIN1, SRC kinase signaling inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCIN1Q9C0H9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRCIN1Q9C0H9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRCIN1Q9C0H9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms