Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NSD3Q9BZ95 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms