Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAPERQ9BY12 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms