Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms