Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms