Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms