Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PMCHL2Q9BQD1 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms