Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX2Q99697 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms