Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SORT1Q99523 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms