Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms