Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SAMD8Q96LT4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SAMD8Q96LT4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SAMD8Q96LT4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SAMD8Q96LT4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SAMD8Q96LT4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SAMD8Q96LT4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SAMD8Q96LT4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SAMD8Q96LT4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SAMD8Q96LT4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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