Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLIP3Q96DZ5 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms