Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR2Q969E8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms