Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-CQ95604 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms