Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L2Q8NAA4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms