Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD53Q8N9V6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms