Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SVBPQ8N300 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SVBPQ8N300 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SVBPQ8N300 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SVBPQ8N300 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SVBPQ8N300 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SVBPQ8N300 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SVBPQ8N300 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SVBPQ8N300 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SVBPQ8N300 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SVBPQ8N300 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SVBPQ8N300 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SVBPQ8N300 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SVBPQ8N300 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SVBPQ8N300 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SVBPQ8N300 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SVBPQ8N300 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SVBPQ8N300 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SVBPQ8N300 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SVBPQ8N300 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SVBPQ8N300 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SVBPQ8N300 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SVBPQ8N300 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SVBPQ8N300 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SVBPQ8N300 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SVBPQ8N300 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SVBPQ8N300 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SVBPQ8N300 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SVBPQ8N300 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SVBPQ8N300 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms