Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBP4Q8N2S1 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
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