Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT28Q7Z3Y7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT28Q7Z3Y7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms