Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRCQ7RTU9 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms