Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TPTE2Q6XPS3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPTE2Q6XPS3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPTE2Q6XPS3 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPTE2Q6XPS3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPTE2Q6XPS3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPTE2Q6XPS3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TPTE2Q6XPS3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPTE2Q6XPS3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TPTE2Q6XPS3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPTE2Q6XPS3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPTE2Q6XPS3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TPTE2Q6XPS3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPTE2Q6XPS3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPTE2Q6XPS3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPTE2Q6XPS3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPTE2Q6XPS3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TPTE2Q6XPS3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPTE2Q6XPS3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPTE2Q6XPS3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPTE2Q6XPS3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TPTE2Q6XPS3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPTE2Q6XPS3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPTE2Q6XPS3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TPTE2Q6XPS3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPTE2Q6XPS3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPTE2Q6XPS3 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms