Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms