Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms