Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SUSD1Q6UWL2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD1Q6UWL2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms