Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms