Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q6P435 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q6P435 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q6P435 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6P435 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6P435 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6P435 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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