Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms