Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC27A4Q6P1M0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms