Protein–RNA interactions for Protein: Q63HK3

ZKSCAN2, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 2, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN2Q63HK3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZKSCAN2Q63HK3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms