Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM4

PRAMEF8, PRAME family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF8Q5VWM4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms