Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSP4

LCN1P1, Putative lipocalin 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN1P1Q5VSP4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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LCN1P1Q5VSP4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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LCN1P1Q5VSP4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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LCN1P1Q5VSP4 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCN1P1Q5VSP4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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LCN1P1Q5VSP4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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LCN1P1Q5VSP4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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LCN1P1Q5VSP4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCN1P1Q5VSP4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCN1P1Q5VSP4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCN1P1Q5VSP4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCN1P1Q5VSP4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCN1P1Q5VSP4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCN1P1Q5VSP4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCN1P1Q5VSP4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCN1P1Q5VSP4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCN1P1Q5VSP4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCN1P1Q5VSP4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN1P1Q5VSP4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN1P1Q5VSP4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN1P1Q5VSP4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN1P1Q5VSP4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN1P1Q5VSP4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN1P1Q5VSP4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN1P1Q5VSP4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN1P1Q5VSP4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN1P1Q5VSP4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN1P1Q5VSP4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN1P1Q5VSP4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCN1P1Q5VSP4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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