Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM164Q5U3C3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms