Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CC2D1BQ5T0F9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CC2D1BQ5T0F9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CC2D1BQ5T0F9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CC2D1BQ5T0F9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CC2D1BQ5T0F9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CC2D1BQ5T0F9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CC2D1BQ5T0F9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CC2D1BQ5T0F9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CC2D1BQ5T0F9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CC2D1BQ5T0F9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CC2D1BQ5T0F9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CC2D1BQ5T0F9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CC2D1BQ5T0F9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CC2D1BQ5T0F9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CC2D1BQ5T0F9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CC2D1BQ5T0F9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CC2D1BQ5T0F9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CC2D1BQ5T0F9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CC2D1BQ5T0F9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CC2D1BQ5T0F9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CC2D1BQ5T0F9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CC2D1BQ5T0F9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CC2D1BQ5T0F9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CC2D1BQ5T0F9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CC2D1BQ5T0F9 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CC2D1BQ5T0F9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CC2D1BQ5T0F9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CC2D1BQ5T0F9 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CC2D1BQ5T0F9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CC2D1BQ5T0F9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CC2D1BQ5T0F9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CC2D1BQ5T0F9 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CC2D1BQ5T0F9 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CC2D1BQ5T0F9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CC2D1BQ5T0F9 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CC2D1BQ5T0F9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CC2D1BQ5T0F9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CC2D1BQ5T0F9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CC2D1BQ5T0F9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CC2D1BQ5T0F9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms