Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CEP170Q5SW79 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms