Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms