Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms