Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GREB1Q4ZG55 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GREB1Q4ZG55 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GREB1Q4ZG55 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GREB1Q4ZG55 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GREB1Q4ZG55 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GREB1Q4ZG55 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GREB1Q4ZG55 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GREB1Q4ZG55 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GREB1Q4ZG55 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms