Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms