Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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