Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms