Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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ECM1Q16610 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
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ECM1Q16610 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
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ECM1Q16610 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ECM1Q16610 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
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