Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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GABRA6Q16445 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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GABRA6Q16445 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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GABRA6Q16445 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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GABRA6Q16445 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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GABRA6Q16445 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA6Q16445 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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