Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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