Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PUM3Q15397 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PUM3Q15397 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PUM3Q15397 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
PUM3Q15397 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PUM3Q15397 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PUM3Q15397 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PUM3Q15397 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PUM3Q15397 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PUM3Q15397 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PUM3Q15397 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PUM3Q15397 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PUM3Q15397 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PUM3Q15397 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PUM3Q15397 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PUM3Q15397 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PUM3Q15397 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PUM3Q15397 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PUM3Q15397 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PUM3Q15397 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PUM3Q15397 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PUM3Q15397 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PUM3Q15397 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PUM3Q15397 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PUM3Q15397 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PUM3Q15397 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PUM3Q15397 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PUM3Q15397 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PUM3Q15397 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PUM3Q15397 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PUM3Q15397 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PUM3Q15397 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PUM3Q15397 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PUM3Q15397 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PUM3Q15397 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PUM3Q15397 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PUM3Q15397 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PUM3Q15397 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PUM3Q15397 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PUM3Q15397 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PUM3Q15397 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PUM3Q15397 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PUM3Q15397 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PUM3Q15397 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PUM3Q15397 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PUM3Q15397 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PUM3Q15397 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PUM3Q15397 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PUM3Q15397 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PUM3Q15397 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PUM3Q15397 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PUM3Q15397 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PUM3Q15397 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PUM3Q15397 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PUM3Q15397 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PUM3Q15397 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PUM3Q15397 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PUM3Q15397 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PUM3Q15397 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PUM3Q15397 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PUM3Q15397 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PUM3Q15397 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PUM3Q15397 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PUM3Q15397 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PUM3Q15397 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PUM3Q15397 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PUM3Q15397 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PUM3Q15397 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PUM3Q15397 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PUM3Q15397 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PUM3Q15397 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PUM3Q15397 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PUM3Q15397 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PUM3Q15397 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PUM3Q15397 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PUM3Q15397 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PUM3Q15397 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PUM3Q15397 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PUM3Q15397 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PUM3Q15397 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PUM3Q15397 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PUM3Q15397 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PUM3Q15397 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PUM3Q15397 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PUM3Q15397 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PUM3Q15397 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PUM3Q15397 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PUM3Q15397 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PUM3Q15397 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PUM3Q15397 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PUM3Q15397 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PUM3Q15397 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PUM3Q15397 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PUM3Q15397 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PUM3Q15397 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PUM3Q15397 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PUM3Q15397 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PUM3Q15397 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PUM3Q15397 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
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