Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms