Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
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