Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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GPNMBQ14956 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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